Veolia: Studie výskytu variant SARS-CoV-2 v odpadních vodách

Monitoring obecného výskytu viru SARS-CoV-2 v odpadních vodách není v současnosti ničím výjimečným. Uvedený projekt se ale zabýval vyšší úrovní identifikace konkrétních typů viru a jeho variant ve vztahu k ostatním epidemiologickým indikátorům, složení a možnosti separace RNA z odpadních vod i vlivu srážkových událostí na vlastní monitoring. Jedním z cílů projektu bylo validovat metodiku, která umožní spolu s dalšími údaji sledovanými zdravotnickými a hygienickými orgány predikovat vývoj pandemie a její následný dopad na zdraví obyvatelstva.

Pro úspěšný průběh projektu bylo nutné vytipovat konkrétní sekvenci, resp. set genových sekvencí charakteristických právě pro konkrétní variantu viru. Vzorky odpadních vod tedy byly analyzovány nejen na prostý výskyt přítomnosti genetického materiálu viru SARS-CoV-2, ale navíc byly u každého vzorku prováděny sekvenace s cílem identifikace výskytu konkrétní varianty, resp. jejího procentuálního zastoupení v celkovém množství přítomného viru.

Zjištěné výsledky byly porovnávány s výsledky zdravotnického monitoringu a dále s dalšími „technickými“ hodnotami, které mohou ovlivňovat výskyt viru v odpadních vodách (vyšší srážky, tání sněhu, proplachy kanalizace, apod.). Důležitost zahrnutí technických kritérií do hodnocení se ukázala např. na konkrétní lokalitě v Anglii, kde vlivem silných srážek došlo k významnému zředění odpadních vod a zde získané výsledky se dočasně odchylovaly od výsledků získaných z dalších evropských lokalit.

Příkladem výstupů může být např. perfektní shoda s ostatními metropolemi při nástupu varianty Omicron, která v rekordním čase „převálcovala“ ostatní varianty i výborná shoda s incidencí onemocnění koronavirem, které sledují národní autority.

Za Českou republiku se projektu zúčastnila společnost Pražské vodovody a kanalizace, a.s. (PVK), konkrétně laboratoř odpadních vod sídlící na pražské Ústřední čistírně odpadních vod. Zpracováním, resp. přípravou dalších vzorků, mimo vzorky odeslané do Francie, se dále zabývala PCR laboratoř, jež je součástí centrálních laboratoří PVK sídlících v Dykově ulici. Laboratoř, jež disponuje vybavením pro PCR analýzy, je schopna analyzovat výskyt prakticky kteréhokoliv mikroorganismu ve vodě. Metoda v současné době např. pomáhá k rychlejší identifikaci bakterií rodu Legionella, které se mohou vyskytovat v teplovodních rozvodech. Našim zákazníkům z řad bytových družstev, provozovatelů bazénů, hotelů a dalších ubytovacích zařízení tak pomáhá snáze a rychleji odhalit případné problémy na jejich rozvodech a předejít tak případným zdravotním problémům uživatelů teplé vody.

Vyvinutá metodika, pořízení vybavení a získané znalosti v budoucnu umožní snáze a rychleji reagovat na potřeby sledování průběhu nejen epidemie, resp. pandemie způsobené virem SARS-CoV-2, ale v podstatě na jakoukoliv jinou událost podobného charakteru způsobenou jiným virem. Data získaná z odpadních vod mohou významně pomoci při zvládání budoucích epidemií díky sledování nejen celkové virové nálože v populaci, ale především díky získání přehledu o zastoupení jednotlivých virových mutací, jež se mohou významně lišit svým působením na lidské zdraví.

Evropská komise i s využitím dat z této studie do svého návrhu revidované směrnice o čištění městských odpadních vod doplnila povinnost od roku 2026 na velkých čistírnách odpadních vod nad 100 000 ekvivalentních obyvatel provádět minimálně 2× ročně právě monitoring SARS-CoV-2 vč. jeho variant.

Díky rutinnímu zavedení PCR analýz i mezinárodní spolupráci je skupina Veolia již nyní na takovou povinnost plně připravena.